Doxygen est un système de documentation pour C, C++, Java, Objective-C, Python, IDL (arômes de Corba et Microsoft), Fortran, VHDL, PHP, c# et à certains d de mesure. Il peut générer un navigateur de documentation en ligne (en HTML) et/ou un manuel de référence hors ligne (en $ $mbox {LaTeX}) d'un ensemble de fichiers sources documentées. Il y a aussi la prise en charge pour générer une sortie en RTF (MS-Word), PostScript, PDF hyperlié, comprimé de HTML et les pages de manuel Unix.